Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PpardP35396 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PpardP35396 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PpardP35396 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PpardP35396 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PpardP35396 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PpardP35396 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PpardP35396 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PpardP35396 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PpardP35396 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PpardP35396 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PpardP35396 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PpardP35396 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpardP35396 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PpardP35396 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpardP35396 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpardP35396 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpardP35396 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpardP35396 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PpardP35396 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpardP35396 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PpardP35396 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpardP35396 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpardP35396 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpardP35396 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpardP35396 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpardP35396 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PpardP35396 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PpardP35396 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PpardP35396 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PpardP35396 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PpardP35396 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PpardP35396 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PpardP35396 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PpardP35396 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PpardP35396 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PpardP35396 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PpardP35396 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PpardP35396 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpardP35396 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpardP35396 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpardP35396 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpardP35396 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpardP35396 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpardP35396 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PpardP35396 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpardP35396 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpardP35396 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpardP35396 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpardP35396 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpardP35396 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpardP35396 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpardP35396 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpardP35396 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpardP35396 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpardP35396 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpardP35396 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PpardP35396 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpardP35396 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpardP35396 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PpardP35396 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PpardP35396 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PpardP35396 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PpardP35396 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PpardP35396 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpardP35396 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpardP35396 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpardP35396 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PpardP35396 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpardP35396 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpardP35396 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpardP35396 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpardP35396 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpardP35396 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PpardP35396 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpardP35396 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpardP35396 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpardP35396 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpardP35396 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpardP35396 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpardP35396 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PpardP35396 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PpardP35396 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PpardP35396 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PpardP35396 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PpardP35396 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PpardP35396 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PpardP35396 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PpardP35396 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PpardP35396 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PpardP35396 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PpardP35396 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PpardP35396 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PpardP35396 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PpardP35396 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PpardP35396 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PpardP35396 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PpardP35396 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PpardP35396 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PpardP35396 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms