Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab17P35292 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab17P35292 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab17P35292 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab17P35292 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab17P35292 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab17P35292 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab17P35292 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab17P35292 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms