Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tfap2aP34056 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms