Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VtnP29788 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VtnP29788 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VtnP29788 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VtnP29788 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VtnP29788 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VtnP29788 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VtnP29788 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VtnP29788 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VtnP29788 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VtnP29788 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VtnP29788 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VtnP29788 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VtnP29788 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VtnP29788 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VtnP29788 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VtnP29788 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VtnP29788 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VtnP29788 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VtnP29788 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VtnP29788 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VtnP29788 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VtnP29788 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VtnP29788 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VtnP29788 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VtnP29788 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VtnP29788 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VtnP29788 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VtnP29788 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VtnP29788 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VtnP29788 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VtnP29788 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VtnP29788 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VtnP29788 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VtnP29788 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VtnP29788 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VtnP29788 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VtnP29788 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VtnP29788 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VtnP29788 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VtnP29788 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VtnP29788 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VtnP29788 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VtnP29788 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VtnP29788 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VtnP29788 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VtnP29788 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VtnP29788 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VtnP29788 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VtnP29788 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VtnP29788 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VtnP29788 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VtnP29788 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VtnP29788 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VtnP29788 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VtnP29788 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VtnP29788 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VtnP29788 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VtnP29788 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VtnP29788 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VtnP29788 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VtnP29788 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VtnP29788 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VtnP29788 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VtnP29788 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VtnP29788 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VtnP29788 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VtnP29788 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VtnP29788 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VtnP29788 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VtnP29788 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VtnP29788 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VtnP29788 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VtnP29788 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VtnP29788 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VtnP29788 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VtnP29788 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VtnP29788 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VtnP29788 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VtnP29788 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VtnP29788 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VtnP29788 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VtnP29788 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VtnP29788 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VtnP29788 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VtnP29788 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VtnP29788 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VtnP29788 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VtnP29788 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VtnP29788 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VtnP29788 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VtnP29788 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VtnP29788 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VtnP29788 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VtnP29788 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VtnP29788 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VtnP29788 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VtnP29788 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VtnP29788 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VtnP29788 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms