Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn10P28658 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn10P28658 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atxn10P28658 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atxn10P28658 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms