Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a9P28571 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms