Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd9P28357 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms