Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LoxP28301 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LoxP28301 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LoxP28301 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LoxP28301 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LoxP28301 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LoxP28301 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LoxP28301 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LoxP28301 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LoxP28301 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LoxP28301 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LoxP28301 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LoxP28301 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LoxP28301 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LoxP28301 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LoxP28301 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LoxP28301 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LoxP28301 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LoxP28301 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LoxP28301 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LoxP28301 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LoxP28301 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LoxP28301 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LoxP28301 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LoxP28301 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LoxP28301 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LoxP28301 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LoxP28301 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LoxP28301 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LoxP28301 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LoxP28301 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LoxP28301 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LoxP28301 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LoxP28301 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LoxP28301 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LoxP28301 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LoxP28301 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LoxP28301 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LoxP28301 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LoxP28301 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LoxP28301 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LoxP28301 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LoxP28301 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LoxP28301 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LoxP28301 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LoxP28301 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LoxP28301 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LoxP28301 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LoxP28301 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LoxP28301 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LoxP28301 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LoxP28301 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LoxP28301 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LoxP28301 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LoxP28301 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LoxP28301 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LoxP28301 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LoxP28301 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LoxP28301 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
LoxP28301 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LoxP28301 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LoxP28301 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LoxP28301 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LoxP28301 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LoxP28301 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LoxP28301 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LoxP28301 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LoxP28301 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LoxP28301 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LoxP28301 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LoxP28301 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LoxP28301 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LoxP28301 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LoxP28301 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LoxP28301 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LoxP28301 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LoxP28301 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LoxP28301 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LoxP28301 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LoxP28301 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LoxP28301 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LoxP28301 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LoxP28301 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LoxP28301 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LoxP28301 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LoxP28301 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LoxP28301 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LoxP28301 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LoxP28301 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LoxP28301 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LoxP28301 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LoxP28301 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LoxP28301 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LoxP28301 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LoxP28301 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LoxP28301 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LoxP28301 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LoxP28301 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LoxP28301 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LoxP28301 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms