Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gjb3P28231 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb3P28231 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms