Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb1P28230 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms