Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PdgfraP26618 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PdgfraP26618 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms