Protein–RNA interactions for Protein: P25318

Col8a2, Collagen alpha-2(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a2P25318 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col8a2P25318 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col8a2P25318 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col8a2P25318 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col8a2P25318 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a2P25318 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a2P25318 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a2P25318 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a2P25318 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a2P25318 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a2P25318 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a2P25318 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a2P25318 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a2P25318 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a2P25318 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a2P25318 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a2P25318 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a2P25318 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a2P25318 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a2P25318 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a2P25318 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a2P25318 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a2P25318 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a2P25318 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col8a2P25318 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col8a2P25318 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col8a2P25318 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a2P25318 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a2P25318 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a2P25318 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a2P25318 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a2P25318 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a2P25318 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col8a2P25318 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col8a2P25318 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a2P25318 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a2P25318 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a2P25318 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a2P25318 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a2P25318 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a2P25318 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a2P25318 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a2P25318 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a2P25318 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a2P25318 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col8a2P25318 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col8a2P25318 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col8a2P25318 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a2P25318 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a2P25318 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a2P25318 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a2P25318 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a2P25318 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a2P25318 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a2P25318 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col8a2P25318 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a2P25318 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a2P25318 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a2P25318 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a2P25318 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a2P25318 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a2P25318 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col8a2P25318 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a2P25318 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a2P25318 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a2P25318 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a2P25318 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a2P25318 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a2P25318 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a2P25318 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a2P25318 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col8a2P25318 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a2P25318 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a2P25318 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col8a2P25318 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.4 ms