Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd12P23812 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms