Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfyaP23708 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfyaP23708 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfyaP23708 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfyaP23708 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfyaP23708 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfyaP23708 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfyaP23708 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfyaP23708 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfyaP23708 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfyaP23708 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfyaP23708 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfyaP23708 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfyaP23708 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms