Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tsta3P23591 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms