Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja1P23242 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja1P23242 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja1P23242 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja1P23242 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja1P23242 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja1P23242 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms