Protein–RNA interactions for Protein: P21126

Ubl4a, Ubiquitin-like protein 4A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4aP21126 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubl4aP21126 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl4aP21126 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms