Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ntf3P20181 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms