Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P20040 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P20040 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P20040 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P20040 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P20040 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P20040 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P20040 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P20040 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P20040 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P20040 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P20040 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P20040 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P20040 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P20040 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P20040 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P20040 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P20040 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P20040 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P20040 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P20040 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P20040 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P20040 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P20040 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P20040 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P20040 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P20040 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P20040 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P20040 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P20040 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P20040 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P20040 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P20040 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P20040 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P20040 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P20040 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P20040 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P20040 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P20040 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P20040 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P20040 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P20040 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P20040 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P20040 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P20040 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P20040 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P20040 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P20040 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P20040 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P20040 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P20040 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P20040 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P20040 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P20040 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P20040 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P20040 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P20040 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P20040 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P20040 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P20040 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P20040 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P20040 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P20040 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P20040 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P20040 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P20040 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P20040 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P20040 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P20040 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P20040 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P20040 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P20040 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P20040 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P20040 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P20040 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P20040 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P20040 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P20040 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P20040 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P20040 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P20040 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P20040 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P20040 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P20040 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P20040 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P20040 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P20040 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P20040 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P20040 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P20040 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P20040 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P20040 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P20040 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P20040 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P20040 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P20040 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P20040 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P20040 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P20040 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P20040 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms