Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csn1s1P19228 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csn1s1P19228 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms