Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P18530 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18530 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18530 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18530 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18530 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18530 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18530 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18530 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18530 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18530 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18530 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18530 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18530 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18530 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18530 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18530 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18530 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18530 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18530 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18530 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18530 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18530 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18530 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18530 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18530 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18530 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18530 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18530 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18530 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18530 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18530 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P18530 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18530 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18530 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18530 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18530 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18530 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18530 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18530 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18530 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18530 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18530 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18530 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18530 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18530 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18530 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18530 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18530 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18530 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18530 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18530 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18530 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18530 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18530 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18530 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18530 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18530 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18530 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18530 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18530 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18530 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P18530 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18530 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18530 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P18530 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18530 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18530 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18530 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18530 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18530 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18530 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18530 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18530 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18530 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18530 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18530 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18530 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18530 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18530 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18530 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18530 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18530 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18530 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18530 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18530 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P18530 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18530 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18530 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18530 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18530 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18530 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18530 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18530 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18530 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18530 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18530 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18530 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18530 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P18530 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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