Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra6P16305 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms