Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irf1P15314 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf1P15314 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf1P15314 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf1P15314 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irf1P15314 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irf1P15314 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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