Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd5P13379 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd5P13379 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd5P13379 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd5P13379 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd5P13379 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd5P13379 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd5P13379 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd5P13379 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms