Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrm1P12657 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrm1P12657 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrm1P12657 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrm1P12657 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms