Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd1d1P11609 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms