Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6c1P0CW02 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ly6c1P0CW02 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ly6c1P0CW02 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ly6c1P0CW02 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ly6c1P0CW02 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ly6c1P0CW02 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ly6c1P0CW02 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ly6c1P0CW02 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ly6c1P0CW02 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ly6c1P0CW02 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ly6c1P0CW02 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ly6c1P0CW02 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms