Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igsf6P0C6B7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms