Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna9P09235 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna9P09235 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms