Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa1P09022 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms