Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtrP07309 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtrP07309 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtrP07309 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtrP07309 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtrP07309 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtrP07309 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtrP07309 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtrP07309 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtrP07309 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtrP07309 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TtrP07309 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TtrP07309 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtrP07309 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtrP07309 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtrP07309 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtrP07309 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtrP07309 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtrP07309 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtrP07309 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtrP07309 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtrP07309 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtrP07309 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtrP07309 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TtrP07309 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtrP07309 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtrP07309 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtrP07309 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtrP07309 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtrP07309 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtrP07309 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtrP07309 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtrP07309 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtrP07309 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtrP07309 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtrP07309 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtrP07309 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtrP07309 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtrP07309 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtrP07309 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtrP07309 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtrP07309 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtrP07309 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TtrP07309 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtrP07309 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtrP07309 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtrP07309 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtrP07309 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtrP07309 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TtrP07309 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TtrP07309 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtrP07309 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtrP07309 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtrP07309 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtrP07309 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TtrP07309 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtrP07309 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtrP07309 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtrP07309 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtrP07309 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtrP07309 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtrP07309 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtrP07309 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtrP07309 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TtrP07309 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TtrP07309 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtrP07309 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtrP07309 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtrP07309 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TtrP07309 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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