Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06323 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06323 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06323 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06323 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06323 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06323 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06323 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06323 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06323 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06323 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06323 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06323 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06323 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06323 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06323 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06323 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06323 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P06323 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06323 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06323 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06323 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06323 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06323 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06323 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06323 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06323 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06323 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06323 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06323 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06323 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06323 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06323 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06323 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06323 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P06323 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P06323 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06323 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06323 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06323 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06323 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P06323 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06323 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06323 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06323 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06323 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P06323 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P06323 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06323 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06323 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06323 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06323 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06323 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06323 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06323 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06323 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06323 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06323 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06323 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06323 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06323 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06323 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06323 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06323 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06323 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06323 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06323 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06323 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06323 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06323 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06323 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06323 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06323 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06323 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06323 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06323 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06323 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06323 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06323 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06323 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06323 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06323 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06323 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06323 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06323 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06323 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06323 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06323 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06323 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06323 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06323 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06323 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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