Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04212 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04212 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04212 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04212 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04212 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P04212 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04212 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04212 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04212 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04212 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04212 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P04212 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04212 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04212 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04212 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04212 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04212 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04212 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04212 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04212 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04212 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P04212 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04212 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04212 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04212 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04212 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04212 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04212 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04212 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04212 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04212 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04212 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04212 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04212 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04212 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04212 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P04212 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04212 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04212 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04212 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04212 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04212 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04212 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04212 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04212 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04212 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P04212 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04212 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04212 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04212 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04212 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04212 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P04212 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04212 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P04212 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04212 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04212 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04212 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04212 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04212 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04212 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04212 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04212 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04212 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04212 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04212 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04212 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04212 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04212 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04212 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04212 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04212 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04212 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04212 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04212 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04212 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04212 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04212 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04212 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04212 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04212 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04212 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04212 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04212 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04212 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04212 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04212 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04212 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P04212 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04212 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04212 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04212 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P04212 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04212 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04212 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04212 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04212 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04212 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04212 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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