Protein–RNA interactions for Protein: P02463

Col4a1, Collagen alpha-1(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a1P02463 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a1P02463 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a1P02463 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a1P02463 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms