Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01649 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01649 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01649 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01649 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01649 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01649 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01649 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01649 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01649 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01649 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01649 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01649 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01649 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01649 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01649 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01649 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01649 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01649 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01649 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01649 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01649 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01649 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01649 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01649 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01649 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01649 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01649 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01649 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01649 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01649 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01649 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01649 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01649 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01649 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.05■□□□□ 0
P01649 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01649 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01649 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01649 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01649 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01649 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01649 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01649 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01649 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01649 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01649 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01649 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01649 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01649 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01649 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01649 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01649 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01649 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01649 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01649 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01649 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01649 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01649 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01649 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01649 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01649 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01649 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01649 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01649 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01649 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01649 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01649 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01649 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01649 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01649 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01649 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01649 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01649 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01649 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01649 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01649 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01649 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01649 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01649 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01649 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01649 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01649 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01649 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01649 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01649 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01649 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01649 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01649 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01649 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01649 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01649 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01649 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01649 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01649 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01649 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
P01649 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
P01649 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P01649 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P01649 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01649 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms