Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C4bP01029 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4bP01029 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4bP01029 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4bP01029 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4bP01029 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4bP01029 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4bP01029 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4bP01029 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4bP01029 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4bP01029 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4bP01029 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4bP01029 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4bP01029 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4bP01029 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4bP01029 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4bP01029 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4bP01029 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4bP01029 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4bP01029 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4bP01029 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4bP01029 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4bP01029 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4bP01029 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4bP01029 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C4bP01029 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C4bP01029 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4bP01029 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4bP01029 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4bP01029 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C4bP01029 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4bP01029 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4bP01029 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4bP01029 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4bP01029 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4bP01029 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4bP01029 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C4bP01029 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4bP01029 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4bP01029 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4bP01029 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4bP01029 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C4bP01029 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4bP01029 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4bP01029 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4bP01029 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4bP01029 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4bP01029 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4bP01029 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4bP01029 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4bP01029 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4bP01029 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4bP01029 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C4bP01029 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4bP01029 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4bP01029 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4bP01029 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4bP01029 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4bP01029 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4bP01029 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4bP01029 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4bP01029 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4bP01029 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4bP01029 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4bP01029 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4bP01029 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C4bP01029 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4bP01029 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C4bP01029 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4bP01029 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4bP01029 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4bP01029 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4bP01029 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4bP01029 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C4bP01029 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4bP01029 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4bP01029 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4bP01029 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4bP01029 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C4bP01029 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C4bP01029 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4bP01029 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4bP01029 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C4bP01029 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4bP01029 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4bP01029 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4bP01029 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4bP01029 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C4bP01029 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4bP01029 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4bP01029 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4bP01029 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4bP01029 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4bP01029 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C4bP01029 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4bP01029 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C4bP01029 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C4bP01029 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C4bP01029 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C4bP01029 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms