Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Robo1O89026 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Robo1O89026 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Robo1O89026 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Robo1O89026 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Robo1O89026 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Robo1O89026 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Robo1O89026 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Robo1O89026 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Robo1O89026 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Robo1O89026 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Robo1O89026 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Robo1O89026 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Robo1O89026 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Robo1O89026 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Robo1O89026 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms