Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcnkO88874 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcnkO88874 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcnkO88874 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcnkO88874 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcnkO88874 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcnkO88874 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcnkO88874 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcnkO88874 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms