Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F11rO88792 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F11rO88792 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F11rO88792 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
F11rO88792 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
F11rO88792 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
F11rO88792 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
F11rO88792 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F11rO88792 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F11rO88792 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F11rO88792 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
F11rO88792 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F11rO88792 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
F11rO88792 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F11rO88792 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
F11rO88792 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F11rO88792 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F11rO88792 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F11rO88792 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F11rO88792 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
F11rO88792 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F11rO88792 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
F11rO88792 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
F11rO88792 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F11rO88792 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F11rO88792 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F11rO88792 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F11rO88792 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F11rO88792 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F11rO88792 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F11rO88792 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
F11rO88792 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
F11rO88792 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F11rO88792 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
F11rO88792 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
F11rO88792 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
F11rO88792 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
F11rO88792 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
F11rO88792 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
F11rO88792 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
F11rO88792 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
F11rO88792 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
F11rO88792 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
F11rO88792 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
F11rO88792 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
F11rO88792 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
F11rO88792 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
F11rO88792 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
F11rO88792 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
F11rO88792 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
F11rO88792 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
F11rO88792 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
F11rO88792 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
F11rO88792 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
F11rO88792 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
F11rO88792 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
F11rO88792 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
F11rO88792 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
F11rO88792 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
F11rO88792 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
F11rO88792 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
F11rO88792 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
F11rO88792 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
F11rO88792 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
F11rO88792 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
F11rO88792 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
F11rO88792 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
F11rO88792 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
F11rO88792 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
F11rO88792 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
F11rO88792 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
F11rO88792 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
F11rO88792 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
F11rO88792 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
F11rO88792 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
F11rO88792 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
F11rO88792 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
F11rO88792 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
F11rO88792 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
F11rO88792 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
F11rO88792 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
F11rO88792 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
F11rO88792 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
F11rO88792 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
F11rO88792 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
F11rO88792 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
F11rO88792 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
F11rO88792 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
F11rO88792 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
F11rO88792 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
F11rO88792 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
F11rO88792 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
F11rO88792 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
F11rO88792 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
F11rO88792 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
F11rO88792 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
F11rO88792 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
F11rO88792 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
F11rO88792 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
F11rO88792 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms