Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hcn2O88703 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcn2O88703 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms