Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt1O88346 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt1O88346 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt1O88346 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms