Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cfdp1O88271 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfdp1O88271 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms