Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna4O70174 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrna4O70174 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms