Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syngr2O55101 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syngr2O55101 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms