Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smarce1O54941 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarce1O54941 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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