Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rdh16O54909 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rdh16O54909 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rdh16O54909 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rdh16O54909 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh16O54909 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rdh16O54909 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rdh16O54909 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rdh16O54909 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rdh16O54909 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rdh16O54909 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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