Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limk2O54785 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limk2O54785 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limk2O54785 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Limk2O54785 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Limk2O54785 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Limk2O54785 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms