Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CrxO54751 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CrxO54751 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CrxO54751 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CrxO54751 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CrxO54751 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CrxO54751 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CrxO54751 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CrxO54751 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CrxO54751 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CrxO54751 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CrxO54751 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CrxO54751 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CrxO54751 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CrxO54751 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CrxO54751 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CrxO54751 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CrxO54751 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CrxO54751 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxO54751 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxO54751 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxO54751 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxO54751 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxO54751 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxO54751 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxO54751 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxO54751 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxO54751 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxO54751 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxO54751 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxO54751 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxO54751 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxO54751 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxO54751 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxO54751 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxO54751 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxO54751 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxO54751 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxO54751 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxO54751 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxO54751 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxO54751 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxO54751 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxO54751 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxO54751 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxO54751 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxO54751 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxO54751 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxO54751 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxO54751 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxO54751 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxO54751 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxO54751 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxO54751 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxO54751 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxO54751 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxO54751 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxO54751 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxO54751 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxO54751 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxO54751 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxO54751 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxO54751 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxO54751 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxO54751 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxO54751 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxO54751 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxO54751 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxO54751 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxO54751 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxO54751 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxO54751 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxO54751 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CrxO54751 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CrxO54751 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CrxO54751 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms