Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr6O54689 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr6O54689 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms