Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cited2O35740 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cited2O35740 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cited2O35740 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cited2O35740 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cited2O35740 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cited2O35740 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms